针对法院调解协议的再审申请，我国民事诉讼法有明确的法律依据。
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百零八条规定：“当事人对已经发生法律效力的调解书，提出证据证明调解违反自愿原则或者调解协议的内容违反法律的，可以申请再审。经人民法院审查属实的，应当再审。”同时，第二百一十二条规定：“当事人申请再审，应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出；有本法第二百零七条第一项、第三项、第十二项、第十三项规定情形的，自知道或者应当知道之日起六个月内提出。”

结合问题，若当事人以调解违反自愿原则或内容违法为由申请再审，需在调解书生效后六个月内提出；若因发现新证据（对应第二百零七条第一项“有新的证据，足以推翻原判决、裁定”的类似情形）申请再审，则自知道或应当知道新证据之日起六个月内提出。只有符合上述法定事由且在时效内申请，法院才可能启动再审程序。
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实践中，当事人在处理法院调解协议再审时易出现以下错误操作：
1. 超期申请再审：部分当事人未注意六个月的时效限制，在调解书生效多年后才申请再审，导致法院直接驳回申请，失去再审机会。
2. 证据准备不充分：仅口头主张调解违反自愿原则或内容违法，却未提供实质性证据（如无胁迫的书面证明、违法条款的法律依据），无法说服法院启动再审。
3. 向错误法院申请：根据法律规定，当事人应向原审人民法院或上一级人民法院申请再审，部分当事人却向其他无关法院提交申请，导致材料被退回，延误时间。

若您曾出现上述错误操作或担心操作不当，建议及时向律师咨询补救措施。
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法院调解协议再审的处理可能受以下特殊情况影响：
1. 发现新证据的特殊情形：若当事人在调解书生效后发现新的关键证据（如调解时对方隐瞒的足以影响协议结果的财产证明、债务凭证），可不受“调解书生效后六个月内”的限制，自知道或应当知道新证据之日起六个月内申请再审，此时法院审查的重点将转向新证据是否足以推翻原调解协议。
2. 调解协议内容违法的特殊情形：若调解协议内容违反法律、行政法规的强制性规定（如协议约定逃避债务、损害国家利益），即使当事人已自愿签署，法院也应再审并撤销违法协议。此时，法院审查的核心是协议内容是否实质违法，而非当事人是否自愿。
3. 原审法院调解程序违法的特殊情形：若调解过程中法院存在程序违法（如未让当事人充分发表意见、调解员与对方存在利害关系未回避），当事人可据此申请再审，法院需审查程序违法是否影响调解结果的公正性。
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法院调解协议再审申请可能存在以下法律风险：
1. 再审申请被驳回风险：若再审事由不成立（如证据不足以证明自愿原则被违反、协议内容未实质违法），法院将驳回申请，当事人需承担案件受理费等费用，且无法通过再审纠正调解结果。例如：某当事人主张调解时受到对方口头威胁，但未提供录音、证人证言等证据，法院以证据不足为由驳回再审申请。
2. 权利无法救济风险：若超期未申请再审，当事人将丧失通过再审程序纠正错误调解的权利，可能导致合法权益长期受损。例如：某当事人在调解书生效后第七个月发现对方隐瞒了关键财产证据，但因超过六个月时效，无法申请再审，只能承担财产损失的后果。

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